Zavod za endokrinologiju se sastoji od stacionarnog dijela, polikliničkog dijela, dnevne bolnice i jedinice za denzitometriju. Svi dijelovi Zavoda se nalaze na lokaciji Rebro, Kišpatićeva 12.

U stacionarnom dijelu Zavoda nalaze se 4 bolesnička kreveta.

U polikliničkom dijelu svakodnevno radi 6 ambulanti, tematski podijeljenih prema vrstama bolesti.

U dnevnoj bolnici se provodi endokrinološka obrada i liječenje pojedinih endokrinoloških bolesti.

U Zavodu je zaposleno 12 liječnika specijalista interne medicine sa subspecijalizacijom iz endokrinologije i dijabetologije ili specijalista  endokrinologije i dijabetologije. Jedna liječnica je na specijalističkom usavršavanju iz endokrinologije i dijabetologije. Deset specijalista su doktori znanosti, a četvero ujedno i nastavnici Medicinskog fakulteta u Zagrebu. Zaposleno je i 11 medicinskih sestara, od kojih je 5 prvostupnica, bolničarka i tajnica Zavoda.

Zavod za endokrinologiju je Referentni centar Ministarstva zdravlja za bolesti nadbubrežne žlijezde i Referentni centar Ministarstva zdravlja za metaboličke bolesti kostiju.

Liječnici Zavoda za endokrinologiju voditelji su Centra za neuroendokrinologiju KBC Zagreb.